Не скажу, что лучше, наверное у каждого кошелька есть свои плюсы и минусы, но Webmoney уже давно пользуюсь и нареканий пока не было. И потом мне кажется безопасность кошелька Webmoney гораздо выше, чем Яндекс.Деньги.

я тоже задавалась этим вопросом и не раз, мне кажется Яндекс немного проще. С вебмани я долго разбиралась, как от туда деньги вывести и много манипуляций провела для этого)))

Я считаю Вебмани, так как в России они не уступают Яндекс-деньгам по функциональности. Зато в ближнем зарубежье(Украина, Беларусь) превосходят их на голову. Так что если часто там бываете, то иметь счет на Вебмани крайне полезно.